MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI02

Total Repeats: 3165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009956	GCC	2	6	209	214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046332
2	NC_009956	CGG	3	9	267	275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046332
3	NC_009956	ACG	2	6	345	350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046332
4	NC_009956	GTC	2	6	370	375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046332
5	NC_009956	GGT	2	6	391	396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046332
6	NC_009956	GGT	2	6	511	516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046332
7	NC_009956	CGA	3	9	538	546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046332
8	NC_009956	GGTG	2	8	571	578	0 %	25 %	75 %	0 %	159046332
9	NC_009956	CGA	2	6	622	627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046332
10	NC_009956	CCGAC	2	10	750	759	20 %	0 %	20 %	60 %	159046332
11	NC_009956	GCGG	2	8	763	770	0 %	0 %	75 %	25 %	159046332
12	NC_009956	CGC	2	6	790	795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046332
13	NC_009956	GC	3	6	887	892	0 %	0 %	50 %	50 %	159046332
14	NC_009956	GGT	2	6	910	915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046332
15	NC_009956	CG	3	6	940	945	0 %	0 %	50 %	50 %	159046332
16	NC_009956	CGG	2	6	948	953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046332
17	NC_009956	GGA	2	6	1084	1089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046332
18	NC_009956	TG	4	8	1131	1138	0 %	50 %	50 %	0 %	159046332
19	NC_009956	GAG	2	6	1145	1150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046332
20	NC_009956	G	6	6	1165	1170	0 %	0 %	100 %	0 %	159046332
21	NC_009956	GTG	2	6	1213	1218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046332
22	NC_009956	GCG	2	6	1256	1261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046332
23	NC_009956	CG	4	8	1260	1267	0 %	0 %	50 %	50 %	159046332
24	NC_009956	CCTCGG	2	12	1323	1334	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	159046332
25	NC_009956	CAG	2	6	1376	1381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046332
26	NC_009956	CAA	2	6	1441	1446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046332
27	NC_009956	GC	3	6	1473	1478	0 %	0 %	50 %	50 %	159046332
28	NC_009956	CGA	2	6	1509	1514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046332
29	NC_009956	CCG	2	6	1562	1567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046332
30	NC_009956	AAC	2	6	1574	1579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046332
31	NC_009956	CTT	2	6	1585	1590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046332
32	NC_009956	CCT	2	6	1632	1637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046332
33	NC_009956	CGA	2	6	1639	1644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046332
34	NC_009956	GCG	2	6	1658	1663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046332
35	NC_009956	GGT	2	6	1684	1689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046332
36	NC_009956	ACG	2	6	1719	1724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046332
37	NC_009956	CG	3	6	1731	1736	0 %	0 %	50 %	50 %	159046332
38	NC_009956	CGA	3	9	1807	1815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046332
39	NC_009956	CGTCG	2	10	1923	1932	0 %	20 %	40 %	40 %	159046333
40	NC_009956	GCC	2	6	2021	2026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046333
41	NC_009956	GCA	3	9	2045	2053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046333
42	NC_009956	GGC	2	6	2155	2160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046333
43	NC_009956	CGA	2	6	2218	2223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046333
44	NC_009956	CGG	2	6	2240	2245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046333
45	NC_009956	CTGG	2	8	2339	2346	0 %	25 %	50 %	25 %	159046333
46	NC_009956	TCA	2	6	2359	2364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046333
47	NC_009956	TCT	2	6	2365	2370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046333
48	NC_009956	GCTG	2	8	2383	2390	0 %	25 %	50 %	25 %	159046333
49	NC_009956	CGGGG	2	10	2399	2408	0 %	0 %	80 %	20 %	159046333
50	NC_009956	CG	3	6	2410	2415	0 %	0 %	50 %	50 %	159046333
51	NC_009956	CCG	2	6	2467	2472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046333
52	NC_009956	CGC	2	6	2615	2620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046333
53	NC_009956	CTG	2	6	2661	2666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046333
54	NC_009956	GATC	2	8	2671	2678	25 %	25 %	25 %	25 %	159046333
55	NC_009956	CTG	2	6	2718	2723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046333
56	NC_009956	GTT	2	6	2753	2758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046333
57	NC_009956	TTC	2	6	2787	2792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046333
58	NC_009956	CTG	2	6	2805	2810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046333
59	NC_009956	GC	3	6	2827	2832	0 %	0 %	50 %	50 %	159046333
60	NC_009956	CGGT	2	8	2925	2932	0 %	25 %	50 %	25 %	159046334
61	NC_009956	TCG	2	6	2977	2982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046334
62	NC_009956	G	6	6	2985	2990	0 %	0 %	100 %	0 %	159046334
63	NC_009956	CGC	2	6	3025	3030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046334
64	NC_009956	ATG	2	6	3051	3056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046334
65	NC_009956	GC	3	6	3142	3147	0 %	0 %	50 %	50 %	159046334
66	NC_009956	TTC	2	6	3189	3194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046334
67	NC_009956	TCGGC	2	10	3196	3205	0 %	20 %	40 %	40 %	159046334
68	NC_009956	CGG	2	6	3217	3222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046334
69	NC_009956	G	6	6	3230	3235	0 %	0 %	100 %	0 %	159046334
70	NC_009956	CCA	2	6	3250	3255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046334
71	NC_009956	CGTC	2	8	3286	3293	0 %	25 %	25 %	50 %	159046334
72	NC_009956	CTG	2	6	3294	3299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046334
73	NC_009956	GCGATT	2	12	3300	3311	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	159046334
74	NC_009956	GC	3	6	3316	3321	0 %	0 %	50 %	50 %	159046334
75	NC_009956	GGT	2	6	3359	3364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046334
76	NC_009956	CCG	2	6	3372	3377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046334
77	NC_009956	ACC	2	6	3402	3407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046334
78	NC_009956	GCC	2	6	3435	3440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046334
79	NC_009956	CCA	2	6	3476	3481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046334
80	NC_009956	CCA	2	6	3520	3525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046334
81	NC_009956	GAT	2	6	3542	3547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046334
82	NC_009956	GGC	2	6	3551	3556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046334
83	NC_009956	TCCT	2	8	3564	3571	0 %	50 %	0 %	50 %	159046334
84	NC_009956	GCCC	2	8	3586	3593	0 %	0 %	25 %	75 %	159046334
85	NC_009956	TGGC	2	8	3651	3658	0 %	25 %	50 %	25 %	159046334
86	NC_009956	TGA	2	6	3673	3678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046334
87	NC_009956	CAAG	2	8	3751	3758	50 %	0 %	25 %	25 %	159046335
88	NC_009956	GGC	2	6	3812	3817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046335
89	NC_009956	GAA	2	6	3823	3828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046335
90	NC_009956	GTG	2	6	3836	3841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046335
91	NC_009956	CG	3	6	3842	3847	0 %	0 %	50 %	50 %	159046335
92	NC_009956	CCA	2	6	3921	3926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046335
93	NC_009956	CGC	2	6	4022	4027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046335
94	NC_009956	CCGAGG	2	12	4125	4136	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	159046335
95	NC_009956	CG	4	8	4147	4154	0 %	0 %	50 %	50 %	159046335
96	NC_009956	CTG	2	6	4157	4162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046335
97	NC_009956	CGGG	2	8	4218	4225	0 %	0 %	75 %	25 %	159046335
98	NC_009956	CAGCGG	2	12	4226	4237	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	159046335
99	NC_009956	CG	3	6	4246	4251	0 %	0 %	50 %	50 %	159046335
100	NC_009956	CTG	2	6	4337	4342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046335
101	NC_009956	GTG	2	6	4400	4405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046335
102	NC_009956	CCG	2	6	4467	4472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046335
103	NC_009956	CTG	2	6	4511	4516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046335
104	NC_009956	GCG	2	6	4517	4522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046335
105	NC_009956	TCC	2	6	4576	4581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046335
106	NC_009956	CGAT	2	8	4587	4594	25 %	25 %	25 %	25 %	159046335
107	NC_009956	CGC	2	6	4790	4795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046336
108	NC_009956	CGG	2	6	4932	4937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046336
109	NC_009956	CGGG	2	8	4977	4984	0 %	0 %	75 %	25 %	159046336
110	NC_009956	CGGGG	2	10	4999	5008	0 %	0 %	80 %	20 %	159046336
111	NC_009956	GAT	2	6	5016	5021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046336
112	NC_009956	GGCGCT	2	12	5034	5045	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	159046336
113	NC_009956	CAG	2	6	5068	5073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046336
114	NC_009956	GGT	2	6	5085	5090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046336
115	NC_009956	GC	5	10	5125	5134	0 %	0 %	50 %	50 %	159046336
116	NC_009956	GCG	2	6	5172	5177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046336
117	NC_009956	GGC	2	6	5206	5211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046336
118	NC_009956	GAT	2	6	5226	5231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046336
119	NC_009956	CGCTGG	2	12	5234	5245	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	159046336
120	NC_009956	GCT	3	9	5259	5267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046336
121	NC_009956	ACC	2	6	5281	5286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046336
122	NC_009956	TGC	2	6	5315	5320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046336
123	NC_009956	CTG	2	6	5323	5328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046336
124	NC_009956	ATGGGC	2	12	5347	5358	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	159046336
125	NC_009956	ATC	2	6	5461	5466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046336
126	NC_009956	GCG	2	6	5503	5508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046336
127	NC_009956	TGG	2	6	5513	5518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046336
128	NC_009956	CGC	2	6	5534	5539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046336
129	NC_009956	GC	3	6	5555	5560	0 %	0 %	50 %	50 %	159046336
130	NC_009956	CCG	2	6	5578	5583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046336
131	NC_009956	CGCGC	2	10	5598	5607	0 %	0 %	40 %	60 %	159046336
132	NC_009956	CG	4	8	5614	5621	0 %	0 %	50 %	50 %	159046336
133	NC_009956	GC	3	6	5677	5682	0 %	0 %	50 %	50 %	159046336
134	NC_009956	CGC	2	6	5688	5693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046336
135	NC_009956	GGA	2	6	5697	5702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046336
136	NC_009956	CGG	2	6	5726	5731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046336
137	NC_009956	CGA	2	6	5786	5791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046337
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140	NC_009956	CCG	2	6	5812	5817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046337
141	NC_009956	CCGA	2	8	5820	5827	25 %	0 %	25 %	50 %	159046337
142	NC_009956	GGCCG	2	10	5855	5864	0 %	0 %	60 %	40 %	159046337
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263	NC_009956	CGG	2	6	12092	12097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046344
264	NC_009956	GCGG	2	8	12139	12146	0 %	0 %	75 %	25 %	159046344
265	NC_009956	GGCT	2	8	12192	12199	0 %	25 %	50 %	25 %	159046344
266	NC_009956	GCC	2	6	12210	12215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046344
267	NC_009956	GCGGT	2	10	12226	12235	0 %	20 %	60 %	20 %	159046344
268	NC_009956	CGGG	2	8	12266	12273	0 %	0 %	75 %	25 %	159046344
269	NC_009956	GC	4	8	12300	12307	0 %	0 %	50 %	50 %	159046344
270	NC_009956	GCG	2	6	12359	12364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046344
271	NC_009956	TGC	2	6	12382	12387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046344
272	NC_009956	AGG	2	6	12388	12393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046344
273	NC_009956	GCC	2	6	12405	12410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046344
274	NC_009956	CCG	2	6	12445	12450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046344
275	NC_009956	GGC	2	6	12457	12462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046344
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277	NC_009956	GGGC	2	8	12500	12507	0 %	0 %	75 %	25 %	159046344
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279	NC_009956	GC	5	10	12594	12603	0 %	0 %	50 %	50 %	159046344
280	NC_009956	GCC	2	6	12627	12632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046344
281	NC_009956	GTG	2	6	12645	12650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046344
282	NC_009956	CGG	2	6	12670	12675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046344
283	NC_009956	CG	3	6	12676	12681	0 %	0 %	50 %	50 %	159046344
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285	NC_009956	TCA	2	6	12943	12948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046345
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289	NC_009956	CGG	2	6	13027	13032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046345
290	NC_009956	TCA	2	6	13051	13056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046345
291	NC_009956	TGC	2	6	13057	13062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046345
292	NC_009956	TGC	2	6	13081	13086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046345
293	NC_009956	CCG	2	6	13102	13107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046345
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299	NC_009956	ATC	2	6	13206	13211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046345
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301	NC_009956	TACC	2	8	13262	13269	25 %	25 %	0 %	50 %	159046345
302	NC_009956	ACA	2	6	13312	13317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046345
303	NC_009956	TTGCTG	2	12	13320	13331	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	159046345
304	NC_009956	TCCT	2	8	13359	13366	0 %	50 %	0 %	50 %	159046345
305	NC_009956	GC	3	6	13408	13413	0 %	0 %	50 %	50 %	159046345
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309	NC_009956	CTGATC	2	12	13560	13571	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	159046345
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342	NC_009956	ATC	2	6	14820	14825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046345
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345	NC_009956	CAT	2	6	14906	14911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046345
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360	NC_009956	GGT	2	6	15332	15337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046345
361	NC_009956	GCG	2	6	15379	15384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046345
362	NC_009956	TCG	2	6	15388	15393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046345
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372	NC_009956	CGG	2	6	15778	15783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046345
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374	NC_009956	CCGGA	2	10	15805	15814	20 %	0 %	40 %	40 %	159046345
375	NC_009956	G	8	8	15870	15877	0 %	0 %	100 %	0 %	159046346
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377	NC_009956	ATC	2	6	15910	15915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046346
378	NC_009956	CTG	2	6	15928	15933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046346
379	NC_009956	GCGG	2	8	15965	15972	0 %	0 %	75 %	25 %	159046346
380	NC_009956	CGG	2	6	16082	16087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046346
381	NC_009956	TGA	2	6	16094	16099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046346
382	NC_009956	GACC	2	8	16128	16135	25 %	0 %	25 %	50 %	159046346
383	NC_009956	GAGGAT	2	12	16147	16158	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	159046346
384	NC_009956	GAG	2	6	16165	16170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046346
385	NC_009956	GCCA	2	8	16172	16179	25 %	0 %	25 %	50 %	159046346
386	NC_009956	ATC	2	6	16191	16196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046347
387	NC_009956	GTG	2	6	16203	16208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046347
388	NC_009956	ATC	2	6	16230	16235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046347
389	NC_009956	GC	3	6	16266	16271	0 %	0 %	50 %	50 %	159046347
390	NC_009956	GTG	2	6	16293	16298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046347
391	NC_009956	GGC	2	6	16331	16336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046347
392	NC_009956	ACC	2	6	16344	16349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046347
393	NC_009956	CG	4	8	16487	16494	0 %	0 %	50 %	50 %	159046347
394	NC_009956	GGC	2	6	16495	16500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046347
395	NC_009956	GTTCCA	2	12	16514	16525	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	159046347
396	NC_009956	GCG	2	6	16540	16545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046347
397	NC_009956	TTC	2	6	16581	16586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046347
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399	NC_009956	TGA	2	6	16615	16620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046347
400	NC_009956	GGC	2	6	16629	16634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046347
401	NC_009956	GC	3	6	16646	16651	0 %	0 %	50 %	50 %	159046347
402	NC_009956	GTG	2	6	16665	16670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046347
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500	NC_009956	CAG	2	6	20185	20190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046352

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